Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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CHD4Q14839 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHD4Q14839 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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