Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF235Q14590 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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