Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERV3-1Q14264 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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