Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A6Q14031 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A6Q14031 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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