Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms