Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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PDE6HQ13956 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PDE6HQ13956 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6HQ13956 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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