Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A4Q13733 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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