Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
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