Protein–RNA interactions for Protein: Q13368

MPP3, MAGUK p55 subfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP3Q13368 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MPP3Q13368 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MPP3Q13368 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MPP3Q13368 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms