Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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