Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2BQ13224 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2BQ13224 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GRIN2BQ13224 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
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