Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT88Q13099 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT88Q13099 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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