Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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GTF3C1Q12789 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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GTF3C1Q12789 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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GTF3C1Q12789 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C1Q12789 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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