Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 YGR149WYGR149W 1299 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 POP8YBL018C 402 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 SLM4YBR077C 489 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 MLC2YPR188C 492 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 ADE12YNL220W 1302 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 RFT1YBL020W 1725 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 SSB1YDL229W 1842 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 SSB2YNL209W 1842 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 GSM1YJL103C 1857 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YDL158CYDL158C 309 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 RRP8YDR083W 1179 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 TRM1YDR120C 1713 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 NQM1YGR043C 1002 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YGR283CYGR283C 1026 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 MTD1YKR080W 963 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 IMD1YAR073W 1212 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 MCH4YOL119C 1506 nt5.1□□□□□ -1.59 RIP-Chip
NOP56Q12460 PNT1YOR266W 1272 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 UBC11YOR339C 471 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 MUM2YBR057C 1101 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YPR142CYPR142C 564 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 SHE3YBR130C 1278 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YBR144CYBR144C 315 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 SLX1YBR228W 915 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 APE3YBR286W 1614 nt5.1□□□□□ -1.59 RIP-Chip
NOP56Q12460 HRP1YOL123W 1605 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 ORC6YHR118C 1308 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 PEX21YGR239C 867 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YKL177WYKL177W 339 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YLR366WYLR366W 306 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YML119WYML119W 1074 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 RUF21RUF21 707 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YNL217WYNL217W 981 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 MDJ2YNL328C 441 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 CPR8YNR028W 927 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YOL118CYOL118C 309 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 TMA16YOR252W 537 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 SET6YPL165C 1122 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 CBP3YPL215W 1008 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 RBD2YPL246C 789 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 STE50YCL032W 1041 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 YDR109CYDR109C 2148 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP56Q12460 FAP1YNL023C 2898 nt5.09□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 GRC3YLL035W 1899 nt5.09□□□□□ -1.6 RIP-Chip
NOP56Q12460 MNN1YER001W 2289 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 ADE3YGR204W 2841 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 PRM7YDL039C 2097 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 KNH1YDL049C 807 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 AIR2YDL175C 1035 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 CNL1YDR357C 369 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 MOG1YJR074W 657 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 ZRT2YLR130C 1269 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YML094C-AYML094C-A 402 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 CSL4YNL232W 879 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 CUS2YNL286W 858 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 snR10snR10 245 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 CSH1YBR161W 1131 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 PGM2YMR105C 1710 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YCR015CYCR015C 954 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 HAT2YEL056W 1206 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 GEP7YGL057C 864 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YAL064WYAL064W 285 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 ORM2YLR350W 651 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YLR365WYLR365W 333 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 ERD2YBL040C 660 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YNL174WYNL174W 573 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 AVT1YJR001W 1809 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 MKS1YNL076W 1755 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 BCP1YDR361C 852 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 SEH1YGL100W 1050 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 FRA2YGL220W 363 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 HIS6YIL020C 786 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 MTW1YAL034W-A 870 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 STB3YDR169C 1542 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 IZH3YLR023C 1632 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 AAD4YDL243C 990 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YGL218WYGL218W 651 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 ALB1YJL122W 528 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 HOT13YKL084W 351 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 JLP1YLL057C 1239 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YMR082CYMR082C 357 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 COG5YNL051W 1212 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 IZH4YOL101C 939 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 VPS21YOR089C 633 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 ECM8YBR076W 1065 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 NGL3YML118W 1518 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 PHO84YML123C 1764 nt5.05□□□□□ -1.6 RIP-Chip
NOP56Q12460 YML082WYML082W 1950 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 TOS4YLR183C 1470 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 MMT2YPL224C 1455 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 CDC15YAR019C 2925 nt5.04□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt5.04□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt5.04□□□□□ -1.6
NOP56Q12460 STD1YOR047C 1335 nt5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.8 ms