Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RAP1YNL216W 2484 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 PNS1YOR161C 1620 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YEN1YER041W 2280 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 NPL4YBR170C 1743 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 NKP1YDR383C 717 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YGL199CYGL199C 471 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 OPI8YKR035C 642 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YAR047CYAR047C 321 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 WRS1YOL097C 1299 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 PRE10YOR362C 867 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CTF19YPL018W 1110 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 IBA57YJR122W 1494 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CYC8YBR112C 2901 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 KNS1YLL019C 2214 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 ARG82YDR173C 1068 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 DIG2YDR480W 972 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 THG1YGR024C 714 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YKL063CYKL063C 504 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 FYV7YLR068W 456 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 SUN4YNL066W 1263 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 AIM39YOL053W 1188 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MFM1YPL060W 1242 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 NTA1YJR062C 1374 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 TDA6YPR157W 1404 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 PRP31YGR091W 1485 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 PCL8YPL219W 1479 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 RPN4YDL020C 1596 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 IXR1YKL032C 1794 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CDC7YDL017W 1524 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CTS2YDR371W 1536 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 WBP1YEL002C 1293 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 ECM14YHR132C 1293 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 NMD5YJR132W 3147 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MIC60YKR016W 1623 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 FAR10YLR238W 1437 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 HXT2YMR011W 1626 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 RVB2YPL235W 1416 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YPR204WYPR204W 3099 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CEF1YMR213W 1773 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 TCM62YBR044C 1719 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 TDP1YBR223C 1635 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 NOG2YNR053C 1461 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MFB1YDR219C 1398 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YDR271CYDR271C 372 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YDR445CYDR445C 408 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MIG3YER028C 1185 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 AGA2YGL032C 264 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 GSF2YML048W 1212 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 IRC21YMR073C 606 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 COS10YNR075W 1125 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 TKL2YBR117C 2046 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 PGI1YBR196C 1665 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 UBP9YER098W 2265 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 RAD18YCR066W 1464 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 STE3YKL178C 1413 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 FYV1YDR024W 486 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MSW1YDR268W 1140 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CAD1YDR423C 1230 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MRPL28YDR462W 444 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 FZF1YGL254W 900 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 PEX21YGR239C 867 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 URA1YKL216W 945 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 UTP30YKR060W 825 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 SYM1YLR251W 594 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YLR252WYLR252W 306 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 NMA1YLR328W 1206 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 TMA16YOR252W 537 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 NIP7YPL211W 546 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 IRC5YFR038W 2562 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CCC2YDR270W 3015 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 ISC1YER019W 1434 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 HST3YOR025W 1344 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MPC2YHR162W 390 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 THP2YHR167W 786 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 BET3YKR068C 582 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 TAL1YLR354C 1008 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YLR400WYLR400W 474 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 MSN2YMR037C 2115 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YMR099CYMR099C 894 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 GIM3YNL153C 390 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 YOL099CYOL099C 492 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CYC2YOR037W 1101 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CUE5YOR042W 1236 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 ETR1YBR026C 1143 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 RPL5YPL131W 894 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 GRE1YPL223C 507 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 EFT2YDR385W 2529 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 EFT1YOR133W 2529 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 GGA1YDR358W 1674 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-DR3Q12441 CSC1YLR241W 2349 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 HMO1YDR174W 741 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MAM1YER106W 909 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 GTR2YGR163W 1026 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 DSE2YHR143W 978 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TPK1YJL164C 1194 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YKL083WYKL083W 615 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 VPH2YKL119C 648 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 PMU1YKL128C 888 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TFS1YLR178C 660 nt6.08□□□□□ -1.44
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