Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 MPP10YJR002W 1782 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SIF2YBR103W 1608 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 BUD22YMR014W 1560 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 RSC6YCR052W 1452 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YHR177WYHR177W 1362 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 COS7YDL248W 1152 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 MRPL7YDR237W 879 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YDR417CYDR417C 372 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 BUD16YEL029C 939 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 COS4YFL062W 1140 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 KEG1YFR042W 603 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 COS5YJR161C 1152 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 NTR2YKR022C 969 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 NIT3YLR351C 876 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 RAD10YML095C 633 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 CCS1YMR038C 750 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 SLM4YBR077C 489 nt4.84□□□□□ -1.63
LCB4Q12246 ADY3YDL239C 2373 nt4.84□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YNL095CYNL095C 1929 nt4.84□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 RRP3YHR065C 1506 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 SLM5YCR024C 1479 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PUS9YDL036C 1389 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 AIM6YDL237W 1173 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 RPL12AYEL054C 498 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PDE1YGL248W 1110 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YGR219WYGR219W 342 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 NMA1YLR328W 1206 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YLR366WYLR366W 306 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 VPS71YML041C 843 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 DAL81YIR023W 2913 nt4.83□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 SAF1YBR280C 1914 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 ARG3YJL088W 1017 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YJR012CYJR012C 624 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YKL107WYKL107W 930 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YLR049CYLR049C 1287 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 COS3YML132W 1140 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 TRS33YOR115C 807 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 snR19snR19 568 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 COS2YBR302C 1140 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YLR345WYLR345W 1530 nt4.82□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 FUM1YPL262W 1467 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 HIR2YOR038C 2628 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YMR111CYMR111C 1389 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 UBC1YDR177W 648 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YDR290WYDR290W 330 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YHB1YGR234W 1200 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 LIP2YLR239C 987 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 MER1YNL210W 813 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YOL162WYOL162W 648 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 MCX1YBR227C 1563 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PAL1YDR348C 1500 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PMA1YGL008C 2757 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 GDB1YPR184W 4611 nt4.81□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PHO12YHR215W 1404 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PUT1YLR142W 1431 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PHO11YAR071W 1404 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 TDA6YPR157W 1404 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 TCM62YBR044C 1719 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 SIS2YKR072C 1689 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 GCN20YFR009W 2259 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 PPG1YNR032W 1107 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 QCR2YPR191W 1107 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YBR134WYBR134W 402 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 MRPL37YBR268W 318 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 HST1YOL068C 1512 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 TEC1YBR083W 1461 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YDL109CYDL109C 1944 nt4.8□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YDR444WYDR444W 2064 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 UBX7YBR273C 1311 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 RPC53YDL150W 1269 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 RPB7YDR404C 516 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 SUI2YJR007W 915 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 SLZ1YNL196C 897 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YNG1YOR064C 660 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 ALG9YNL219C 1668 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 UGA1YGR019W 1416 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YEH2YLR020C 1617 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 APM2YHL019C 1818 nt4.79□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 TPS3YMR261C 3165 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YMR1YJR110W 2067 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 DDI2YFL061W 678 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 GEP7YGL057C 864 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YGR153WYGR153W 654 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 DDI3YNL335W 678 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 GLO4YOR040W 858 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 SPS4YOR313C 1017 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 ECM33YBR078W 1290 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 TAZ1YPR140W 1146 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 ERG4YGL012W 1422 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 BDP1YNL039W 1785 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 CYK3YDL117W 2658 nt4.78□□□□□ -1.64
LCB4Q12246 NEM1YHR004C 1341 nt4.77□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 HOF1YMR032W 2010 nt4.77□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 MHF2YDL160C-A 243 nt4.77□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 PEX27YOR193W 1131 nt4.77□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 MGS1YNL218W 1764 nt4.77□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 STE7YDL159W 1548 nt4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 908.6 ms