Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1B1Q10567 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1B1Q10567 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1B1Q10567 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms