Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP300Q09472 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP300Q09472 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP300Q09472 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP300Q09472 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP300Q09472 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EP300Q09472 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP300Q09472 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EP300Q09472 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EP300Q09472 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EP300Q09472 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP300Q09472 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP300Q09472 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP300Q09472 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP300Q09472 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP300Q09472 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP300Q09472 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP300Q09472 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP300Q09472 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EP300Q09472 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP300Q09472 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP300Q09472 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EP300Q09472 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP300Q09472 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP300Q09472 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP300Q09472 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP300Q09472 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP300Q09472 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP300Q09472 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP300Q09472 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP300Q09472 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP300Q09472 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP300Q09472 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP300Q09472 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP300Q09472 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP300Q09472 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP300Q09472 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms