Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf54Q08AI8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C2orf54Q08AI8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf54Q08AI8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms