Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB2Q08289 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB2Q08289 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms