Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRSF4Q08170 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms