Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FOXM1Q08050 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXM1Q08050 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms