Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE4BQ07343 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms