Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CHRNDQ07001 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNDQ07001 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHRNDQ07001 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNDQ07001 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNDQ07001 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNDQ07001 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNDQ07001 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNDQ07001 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHRNDQ07001 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHRNDQ07001 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CHRNDQ07001 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNDQ07001 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms