Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LTBQ06643 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBQ06643 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBQ06643 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBQ06643 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBQ06643 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBQ06643 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBQ06643 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBQ06643 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms