Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNP2Q05952 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNP2Q05952 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms