Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTK2Q05397 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms