Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR4Q05215 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR4Q05215 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms