Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YPS7YDR349C 1791 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 NUG1YER006W 1563 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 UBC1YDR177W 648 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 RMD5YDR255C 1266 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 ATP5YDR298C 639 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 TYW3YGL050W 822 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SPO74YGL170C 1242 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SKI8YGL213C 1194 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 TLG2YOL018C 1194 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YPL114WYPL114W 420 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 TIF5YPR041W 1218 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YMR102CYMR102C 2505 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 OSH2YDL019C 3852 nt4.46□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 IKS1YJL057C 2004 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SCM3YDL139C 672 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YEL067CYEL067C 588 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SPR6YER115C 576 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MPC1YGL080W 393 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YLR402WYLR402W 192 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MDG1YNL173C 1101 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MAP2YBL091C 1266 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 RGS2YOR107W 930 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SRB6YBR253W 366 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 REI1YBR267W 1182 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MAD3YJL013C 1548 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 CTF18YMR078C 2226 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SEO1YAL067C 1782 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MNT2YGL257C 1677 nt4.45□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 KEX1YGL203C 2190 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YDR274CYDR274C 372 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SPS19YNL202W 879 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YNL217WYNL217W 981 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YOR289WYOR289W 756 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 UBA3YPR066W 900 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 ECM32YER176W 3366 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 HCM1YCR065W 1695 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 TRS85YDR108W 2097 nt4.44□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YOL153CYOL153C 1746 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 RAD30YDR419W 1899 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MAG2YLR427W 2013 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MED2YDL005C 1296 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YDR445CYDR445C 408 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 HSP31YDR533C 714 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YER134CYER134C 537 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YRA2YKL214C 612 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 PPA2YMR267W 933 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 OPT2YPR194C 2634 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 GAS4YOL132W 1416 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 PSY4YBL046W 1326 nt4.43□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 FRS1YLR060W 1788 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 LAP3YNL239W 1365 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SWC3YAL011W 1878 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YJL215CYJL215C 360 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YLR036CYLR036C 612 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 IMD3YLR432W 1572 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YOL050CYOL050C 321 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YDL109CYDL109C 1944 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 TCO89YPL180W 2400 nt4.42□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 DHH1YDL160C 1521 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 RPP1AYDL081C 321 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 GRE3YHR104W 984 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 AAD10YJR155W 867 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YKL023WYKL023W 834 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YNK1YKL067W 462 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 YOL024WYOL024W 519 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MFM1YPL060W 1242 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 NFI1YOR156C 2181 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 PUT2YHR037W 1728 nt4.41□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 EKI1YDR147W 1605 nt4.4□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 SAT4YCR008W 1812 nt4.4□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MCM2YBL023C 2607 nt4.4□□□□□ -1.7
RRN11Q04712 MCM21YDR318W 1107 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 YNL134CYNL134C 1131 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 MVD1YNR043W 1191 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 TRS33YOR115C 807 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 RAD17YOR368W 1206 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 YPR071WYPR071W 636 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 GAS5YOL030W 1455 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 MIF2YKL089W 1650 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 NUP133YKR082W 3474 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 VPS36YLR417W 1701 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 MET12YPL023C 1974 nt4.4□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 CPR4YCR069W 957 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 SAE3YHR079C-A 276 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 RPS0BYLR048W 759 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 NMD4YLR363C 657 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 POP3YNL282W 588 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 ATG14YBR128C 1035 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 LYS2YBR115C 4179 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 RPN6YDL097C 1305 nt4.39□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 KIC1YHR102W 3243 nt4.38□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 MEF2YJL102W 2460 nt4.38□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 YDL241WYDL241W 372 nt4.38□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 INO2YDR123C 915 nt4.38□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 CYC1YJR048W 330 nt4.38□□□□□ -1.71
RRN11Q04712 YPL077CYPL077C 723 nt4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.3 ms