Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7AQ04656 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATP7AQ04656 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7AQ04656 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7AQ04656 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7AQ04656 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7AQ04656 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7AQ04656 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7AQ04656 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7AQ04656 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7AQ04656 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7AQ04656 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7AQ04656 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7AQ04656 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7AQ04656 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7AQ04656 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7AQ04656 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7AQ04656 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATP7AQ04656 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATP7AQ04656 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATP7AQ04656 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ATP7AQ04656 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ATP7AQ04656 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ATP7AQ04656 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ATP7AQ04656 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATP7AQ04656 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms