Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 ARC40YBR234C 1155 nt4.88□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 KIN4YOR233W 2403 nt4.88□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 APE1YKL103C 1545 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 OCA4YCR095C 1089 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 RPS16BYDL083C 432 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 COX4YGL187C 468 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 GPP1YIL053W 753 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YIL171WYIL171W 330 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 OLE1YGL055W 1533 nt4.87□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 CTT1YGR088W 1689 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 GAL4YPL248C 2646 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 PER1YCR044C 1074 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 HST4YDR191W 1113 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YNL194CYNL194C 906 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 VHS2YIL135C 1311 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 GIP2YER054C 1647 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 EAR1YMR171C 1653 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YOL153CYOL153C 1746 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 MPP10YJR002W 1782 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 SSB1YDL229W 1842 nt4.86□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 SKG6YHR149C 2205 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 MRP4YHL004W 1185 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 FMP33YJL161W 543 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YLR346CYLR346C 306 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 MCM1YMR043W 861 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 HEK2YBL032W 1146 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 TIF34YMR146C 1044 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 GAS3YMR215W 1575 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 YTA12YMR089C 2478 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 TSL1YML100W 3297 nt4.85□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 EGT2YNL327W 3126 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 APL6YGR261C 2430 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 HOF1YMR032W 2010 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 LAS1YKR063C 1509 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 RAD52YML032C 1416 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 EAF5YEL018W 840 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 SKI6YGR195W 741 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 PER33YLR064W 822 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 ADD37YMR184W 597 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 EOS1YNL080C 1101 nt4.84□□□□□ -1.63
UBX2Q04228 RSM10YDR041W 612 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 AHA1YDR214W 1053 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 YDR282CYDR282C 1245 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 LSB1YGR136W 726 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 FBP1YLR377C 1047 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 MED4YOR174W 855 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 DBF2YGR092W 1719 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 PRT1YOR361C 2292 nt4.83□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 PRD1YCL057W 2139 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 IES6YEL044W 501 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 DAM1YGR113W 1032 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RPS0AYGR214W 759 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 COS6YGR295C 1146 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 FLD1YLR404W 858 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 MDM12YOL009C 816 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 IMA3YIL172C 1770 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 IMA4YJL221C 1770 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 TCB3YML072C 4638 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 PAH1YMR165C 2589 nt4.82□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 FUR1YHR128W 651 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RAD27YKL113C 1149 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 CWC25YNL245C 540 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RFA2YNL312W 822 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 NUP2YLR335W 2163 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 AGA1YNR044W 2178 nt4.81□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 MDM34YGL219C 1380 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 MSW1YDR268W 1140 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 OTU1YFL044C 906 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RPL24AYGL031C 468 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 TOM7YNL070W 183 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 YDC1YPL087W 954 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 POP4YBR257W 840 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 SEC2YNL272C 2280 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 USA1YML029W 2517 nt4.8□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 ISR1YPR106W 1332 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 YCR006CYCR006C 474 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RTT103YDR289C 1230 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 BCP1YDR361C 852 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 TVP38YKR088C 1014 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 MET16YPR167C 786 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 GIP1YBR045C 1920 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 CDC48YDL126C 2508 nt4.79□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 CDS1YBR029C 1374 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 RRN11YML043C 1524 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 ATG1YGL180W 2694 nt4.78□□□□□ -1.64
UBX2Q04228 LCB2YDR062W 1686 nt4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms