Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RELAQ04206 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RELAQ04206 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RELAQ04206 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELAQ04206 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELAQ04206 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELAQ04206 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELAQ04206 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELAQ04206 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELAQ04206 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELAQ04206 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RELAQ04206 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RELAQ04206 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RELAQ04206 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELAQ04206 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms