Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	ECT1	YGR007W	972 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	LNP1	YHR192W	837 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	LSO1	YJR005C-A	282 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	SFK1	YKL051W	1062 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	BUB3	YOR026W	1026 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	RET3	YPL010W	570 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	YPR059C	YPR059C	387 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	NAT3	YPR131C	588 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	MCM2	YBL023C	2607 nt		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	PRP43	YGL120C	2304 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	GAS2	YLR343W	1668 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	BDP1	YNL039W	1785 nt		5.15	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	GCV1	YDR019C	1203 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YER084W	YER084W	387 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CDC12	YHR107C	1224 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	UTP11	YKL099C	753 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	PPA2	YMR267W	933 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CUS2	YNL286W	858 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CDC28	YBR160W	897 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CTF18	YMR078C	2226 nt		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CAB3	YKL088W	1716 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	NVJ1	YHR195W	966 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	MHO1	YJR008W	1017 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YMR082C	YMR082C	357 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	NTA1	YJR062C	1374 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	HER2	YMR293C	1395 nt		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	GAS5	YOL030W	1455 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YGR125W	YGR125W	3111 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	PCA1	YBR295W	3651 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	RCR2	YDR003W	633 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	BUR6	YER159C	429 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	ERV14	YGL054C	417 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YLR402W	YLR402W	192 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	MSK1	YNL073W	1731 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	FLC1	YPL221W	2382 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	STE7	YDL159W	1548 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YMR221C	YMR221C	1515 nt		5.13	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YCR085W	YCR085W	354 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	IRC22	YEL001C	678 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	RKM2	YDR198C	1440 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CDC4	YFL009W	2340 nt		5.12	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	APM2	YHL019C	1818 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	NFI1	YOR156C	2181 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	FLO8	YER109C	2400 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	SPR28	YDR218C	1272 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	ARC1	YGL105W	1131 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	DSD1	YGL196W	1287 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	TIM21	YGR033C	720 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	PSR1	YLL010C	1284 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YPL071C	YPL071C	471 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	SVF1	YDR346C	1446 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	PAL1	YDR348C	1500 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	ALG2	YGL065C	1512 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YIL001W	YIL001W	1542 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YCR023C	YCR023C	1836 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	JHD2	YJR119C	2187 nt		5.11	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	KRE29	YER038C	1395 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	ZPR1	YGR211W	1461 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YOR131C	YOR131C	657 nt		5.1	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	HIS4	YCL030C	2400 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YDR444W	YDR444W	2064 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	TDA7	YNL176C	1911 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	RNA15	YGL044C	891 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CAX4	YGR036C	720 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	MIC26	YGR235C	702 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YET2	YMR040W	483 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	YPL114W	YPL114W	420 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	ANT1	YPR128C	987 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	VHC1	YBR235W	3363 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	CLF1	YLR117C	2064 nt		5.09	□□□□□ -1.59
SYF1	Q04048	SEC9	YGR009C	1956 nt		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MOT2	YER068W	1764 nt		5.09	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	SPC105	YGL093W	2754 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	LAP3	YNL239W	1365 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	TRM11	YOL124C	1302 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	NUP42	YDR192C	1293 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	HNT2	YDR305C	654 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	CAF16	YFL028C	870 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	GMH1	YKR030W	822 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	SWC3	YAL011W	1878 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	FZO1	YBR179C	2568 nt		5.08	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	TDA11	YHR159W	1515 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MTR10	YOR160W	2919 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	RTN1	YDR233C	888 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YFL068W	YFL068W	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	EFB1	YAL003W	621 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YJR038C	YJR038C	363 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YJR096W	YJR096W	849 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	RPL14A	YKL006W	417 nt		5.07	□□□□□ -1.6

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