Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFAIP2Q03169 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms