Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP4Q02446 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP4Q02446 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP4Q02446 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SP4Q02446 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP4Q02446 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP4Q02446 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP4Q02446 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP4Q02446 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP4Q02446 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP4Q02446 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SP4Q02446 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SP4Q02446 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SP4Q02446 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP4Q02446 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP4Q02446 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP4Q02446 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP4Q02446 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP4Q02446 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP4Q02446 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP4Q02446 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP4Q02446 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP4Q02446 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP4Q02446 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP4Q02446 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP4Q02446 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP4Q02446 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP4Q02446 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP4Q02446 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP4Q02446 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP4Q02446 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP4Q02446 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP4Q02446 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP4Q02446 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SP4Q02446 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SP4Q02446 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SP4Q02446 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms