Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
XPCQ01831 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
XPCQ01831 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
XPCQ01831 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
XPCQ01831 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
XPCQ01831 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
XPCQ01831 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
XPCQ01831 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
XPCQ01831 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
XPCQ01831 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
XPCQ01831 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
XPCQ01831 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
XPCQ01831 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
XPCQ01831 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
XPCQ01831 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
XPCQ01831 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
XPCQ01831 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
XPCQ01831 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
XPCQ01831 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
XPCQ01831 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
XPCQ01831 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
XPCQ01831 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
XPCQ01831 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
XPCQ01831 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
XPCQ01831 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
XPCQ01831 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
XPCQ01831 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
XPCQ01831 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms