Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GALK2Q01415 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GALK2Q01415 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GALK2Q01415 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GALK2Q01415 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GALK2Q01415 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GALK2Q01415 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms