Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms