Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL1Q00532 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL1Q00532 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms