Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAP84074 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAP84074 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAP84074 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAP84074 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAP84074 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPCAP84074 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAP84074 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAP84074 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAP84074 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms