Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX1P83916 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX1P83916 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX1P83916 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX1P83916 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX1P83916 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX1P83916 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX1P83916 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX1P83916 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX1P83916 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX1P83916 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX1P83916 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX1P83916 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX1P83916 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX1P83916 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX1P83916 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX1P83916 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX1P83916 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX1P83916 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms