Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAE1P78406 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAE1P78406 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAE1P78406 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAE1P78406 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAE1P78406 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAE1P78406 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAE1P78406 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAE1P78406 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAE1P78406 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAE1P78406 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAE1P78406 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAE1P78406 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAE1P78406 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAE1P78406 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAE1P78406 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAE1P78406 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAE1P78406 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAE1P78406 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAE1P78406 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms