Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTNAP1P78357 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP1P78357 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP1P78357 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP1P78357 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP1P78357 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP1P78357 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms