Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 523.48■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 33.2
EIF4G2P78344 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 33.2
EIF4G2P78344 EXOSC7-207ENST00000481405 768 ntTSL 341.87■■■■■ 4.298e-8■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.711e-14■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 CDC25B-206ENST00000467519 1960 ntTSL 1 (best)25.46■■□□□ 1.671e-14■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EPB41L1-207ENST00000406771 652 ntTSL 522.74■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EPB41L1-209ENST00000430276 896 ntTSL 521.08■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 520.2■□□□□ 0.828e-8■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 219.87■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 517.03■□□□□ 0.328e-8■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.318e-8■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EPB41L1-210ENST00000432589 210 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EXOSC7-208ENST00000482004 559 ntTSL 413.69□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.994e-10■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.344e-10■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 TAL1-206ENST00000481091 504 ntTSL 321.53■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 PRKCD-203ENST00000464818 777 ntTSL 523.66■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 33.1
EIF4G2P78344 ZFPM2-204ENST00000518180 596 ntTSL 47.11□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 33
EIF4G2P78344 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.829e-8■■■■■ 33
EIF4G2P78344 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.379e-8■■■■■ 33
EIF4G2P78344 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 INPP5A-205ENST00000445580 610 ntTSL 518.51■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 SYNJ2-203ENST00000367113 939 ntTSL 211.11□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 SYNJ2-205ENST00000449320 680 ntTSL 410.76□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 PIAS1-203ENST00000562190 766 ntTSL 310.68□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 PIAS1-206ENST00000564915 671 ntTSL 510.59□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 33
EIF4G2P78344 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.674e-8■■■■■ 32.8
EIF4G2P78344 PEX14-203ENST00000491661 637 ntTSL 212.67□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 32.8
EIF4G2P78344 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.087e-7■■■■■ 32.8
EIF4G2P78344 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.777e-7■■■■■ 32.8
EIF4G2P78344 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.717e-7■■■■■ 32.8
EIF4G2P78344 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.129e-7■■■■■ 32.6
EIF4G2P78344 STXBP2-216ENST00000599648 472 ntTSL 226.52■■□□□ 1.844e-14■■■■■ 32.6
EIF4G2P78344 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 32.6
EIF4G2P78344 CSRNP1-202ENST00000514182 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 32.6
EIF4G2P78344 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.84e-7■■■■■ 32.6
EIF4G2P78344 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 32.6
EIF4G2P78344 BTBD1-204ENST00000559652 797 ntTSL 310.51□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 32.6
EIF4G2P78344 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.759e-7■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.759e-7■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 NTRK1-205ENST00000497019 2508 ntTSL 225.42■■□□□ 1.669e-7■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.569e-7■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.299e-7■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 NTRK1-207ENST00000530298 3052 ntTSL 219.27■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 TMEM164-205ENST00000461715 711 ntTSL 39.8□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 32.5
EIF4G2P78344 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.042e-6■■■■■ 32.4
EIF4G2P78344 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.962e-6■■■■■ 32.4
EIF4G2P78344 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 32.4
EIF4G2P78344 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.361e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 PTPRS-209ENST00000591760 478 ntTSL 235.83■■■■□ 3.331e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SYNGAP1-206ENST00000479510 2073 ntTSL 234.43■■■■□ 3.11e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 GPR75-ASB3-203ENST00000498475 736 ntTSL 533.31■■■□□ 2.921e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 GPR75-ASB3-202ENST00000459916 556 ntTSL 433.31■■■□□ 2.921e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.671e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 531.54■■■□□ 2.641e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.51e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SDSL-203ENST00000546672 839 ntTSL 329.95■■■□□ 2.391e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SYNGAP1-227ENST00000638142 2499 ntTSL 528.01■■■□□ 2.071e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.811e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 NUMA1-213ENST00000537217 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.541e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)21■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SH3BGR-206ENST00000440288 585 ntTSL 520.86■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 32.2
EIF4G2P78344 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 32.2
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 105.1 ms