Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX1P78337 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX1P78337 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX1P78337 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX1P78337 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX1P78337 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX1P78337 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX1P78337 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX1P78337 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX1P78337 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX1P78337 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITX1P78337 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITX1P78337 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX1P78337 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX1P78337 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms