Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN2AP68543 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN2AP68543 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms