Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPNP63162 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPNP63162 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPNP63162 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPNP63162 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPNP63162 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms