Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms