Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL30P62888 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL30P62888 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL30P62888 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL30P62888 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL30P62888 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL30P62888 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL30P62888 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL30P62888 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL30P62888 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL30P62888 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL30P62888 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL30P62888 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL30P62888 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL30P62888 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms