Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHOBP62745 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RHOBP62745 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RHOBP62745 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOBP62745 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOBP62745 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOBP62745 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOBP62745 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOBP62745 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOBP62745 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOBP62745 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOBP62745 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOBP62745 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOBP62745 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOBP62745 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOBP62745 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHOBP62745 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms